Birçok
bakteri türü hidrojen gazının tek elektron vericisi olduğu ve
oksijenin de elektron alıcısı olduğu ortamlarda büyüyebilme özelliğine
sahiptir.
H2
+ O2 --> 2 H2O
Bu
organizmaların da birçoğu ototrofik
olarak büyüyebilirler. Bütün hidrojen oksitleyen bakteriler, bir
ya da birden fazla hidrojenaz enzimine sahiptirler. Bu enzim H2'nin
bağlanması görevini üstlenir. Bu H2 daha sonra ya ATP
üretmek için ya da ototrofik büyüme sırasında kullanılır.
Hemen
hemen bütün hidrojen bakterileri fakültatifkemolitotroflardır. Fakültatif
olmaları onların organik bileşikleri enerji kaynağı olarak kullanabildikleri
yani kemoorganotrofik
olarak da yaşayabildiklerini gösterir. Bu durum hidrojen kemolitotroflarını
birçok kükürt ve azot kemolitotroflarından ayıran bir özelliktir
çünkü kükürt ve azot kemolitotrofları "zorunlu kemolitotrof"tur.
Yani inorganik bir enerji kaynağı olmaması durumunda büyüme gerçekleşmez.
Bunun tersine hidrojen kemolitotrofları, duruma göre kemolitotrof
ya da kemoorganotrof olarak yaşayabilirler.
Bazı
hidrojen baterileri karbonmonoksit'i (CO) enerji kaynağı olarak
kullanabilirler. Bu bakterilerin CO tüketimi ekolojik açıdan çok
önemlidir. İnsanlar tarafından çok fazla üretilen CO, bu bakteriler
sayesinde önemli bir artış göstermemiştir.