4. Phylum (Şube): Ciliophora (Silliler)

En gelişmiş protista grubudur. Çok sayıda mikronükleus (küçük) ve tek bir makronükleus (büyük) taşırlar. Mikronükleus üremeden sorumludur ve mitotik bölünür, makronükleus ise metabolizmadan sorumludur ve amitotik bölünür.
Sililerde bulunan protein yapıdaki zara "pelikula" adı verilir ve pelikulanın kalınlığı, türlere göre değişkenlik gösterir.
Boşaltımdan, kontraktil vakuol sorumludur.

Entodiniomorpha üyeleri, memelilerin sindirim sisteminde kommensal olarak yaşarlar ve selüloz sindirimine yardımcı olurlar.
Bu şubenin sistematiği şöyledir:

1. Classis (Sınıf): Ciliata (Silliler)

Paramecium

1.Subclassis (Alt sınıf): Holotrichia 1.Ordo (Takım): Gymnostomatida (Dileptus spp., Didinium spp.) 2.Ordo (Takım): Trichostomatida (Balantidium spp.) 3.Ordo (Takım): Hymenostomatida (Paramecium spp.)

Vorticella

2.Subclassis (Alt sınıf): Peritrichia Ordo (Takım): Peritrichida (Vorticella spp.)

Vorticella

3.Subclassis (Alt sınıf): Suctoria Ordo (Takım): Suctorida

Entodinium

4.Subclassis (Alt sınıf): Spirotrichia 1.Ordo (Takım): Entodiniomorpha (Entodinium spp.) 2.Ordo (Takım): Hypotrichida (Stylonychia spp.) 3.Ordo (Takım): Heterotrichida (Spirostomum spp.)